與舉世聞名的莫高窟隔河相望，占地面積2萬多平方米，建筑面積5千多平方米，由日本政府無償援建，于1992年2月開工，1994年3月落成，是中華人民共和國和日本國友好的象征。

    敦煌石窟文物保護研究陳列中心是中國唯一的石窟類文物保護研究陳列機構。該中心陳列部分設有錄相演播廳和三個展區，敦煌石窟藝術的精華和發展歷程的概況在此得以展現。錄相演播廳向觀眾放映有關敦煌石窟藝術和陳列中心概況的錄相片。第一展區八個原大復制洞窟是敦煌莫高窟各時期的杰出代表窟，展現了自十六國至元代一千多年間敦煌石窟藝術的風采。

    第二展區為"敦煌石窟文物陳列"，展出敦煌石窟出土的文物精品，設有敦煌莫高窟的創建，敦煌壁畫摹本珍品，敦煌石窟的創建過程和畫工繪制洞窟使用過的繪畫工具。莫高窟發現的精美的古代絲織物、藏經洞發現的古代寫本真跡、敦煌花磚藝術等陳列單元。

    第三展區位于陳列中心展廳的二樓，是輔助展區，可以舉辦各種展覽和專題文物陳列。