WTO的基本原則是在繼承GATT(Generalon Tariffs and Trade:關稅與貿易總協定)基本原則的基礎上，進行必要的補充和修改而來的。它們源自于1994年的GATT、服務貿易總協定和歷次多邊貿易談判所達成的一系列協議。最主要的幾項原則如下：
    
    最惠國待遇原則
    
    最惠國待遇是指締約一方現在和將來給予任何第三方的優惠，也給予所有締約方。在國際貿易中，最惠國待遇是指簽訂雙邊或多邊貿易協議的一方在貿易、關稅、航運、公民法律地位等方面，給予任何第三方的減讓、特權、優惠或豁免時，締約另一方或其他締約方也可以得到相同的待遇。
    
    國民待遇原則
    
    國民待遇是指在貿易條約或協議中，締約方之間相互保證給予對方的自然人(公民)、法人(企業)和商船在本國境內享有與本國自然人、法人和商船同等的待遇。就是把外國的商品當作本國商品對待，把外國企業當作本國企業對待。其目的是為了公平競爭，防止歧視性保護，實現貿易自由化。
    
    無歧視待遇原則
    
    無歧視待遇原則又叫無差別待遇原則，是WIO最重要的原則之一。它規定締約方一方在實施某種限制或禁止措施時，不得對其他締約方實施歧視待遇。無歧視待遇的原則要求每個締約方在任何貿易活動中，都要給予其他締約方以平等待遇，使所有締約方能在同樣的條件下進行貿易。
    
    互惠原則
    
    互惠是指兩國或多國之間在貿易利益或特權方面的相互或相應讓與?；セ菰瓌t體現在關稅、運輸、非關稅壁壘方面削減和知識產權方面的相互保護等。
    
    關稅減讓原則
    
    關稅和非關稅措施是國家管制進出口貿易的兩種常用方式。與名目繁多的非關稅措施相比，關稅的最大優點是它具有公開性和可計量性，能夠清楚地反映關稅對國內產業的保護程度。在WTO中，關稅是惟一合法的保護方式。不斷地降低關稅是WTO最重要的原則之一。目前，關稅的總體水平，發達國家大約在4％以下，發展中國家約為10％左右。
    
    取消數量限制原則
    
    數量限制是非關稅壁壘中最常用的方法，是政府慣用的手段，常被用來限制進出口數量。WTO倡導貿易自由化，主張取消任何非關稅壁壘。
    
    數量限制的主要形式是：配額、進口許可、自動出口約束和禁止。
    
    透明度原則
    
    貿易自動化和穩定性是WTO的主要宗旨，而實現這一宗旨，有賴于增強貿易規章和政策措施的透明度。因此，WTO為各締約方的貿易法律、規章、政策、決策和裁決規定了必須公開的透明度原則。其目的在于防止締約方之間進行不公平的貿易。透明度原則已經成為各締約方在貨物貿易、技術貿易和服務貿易中應遵守的一項基本原則，它涉及到貿易的所有領域。